Dr Donath a contribué à la compréhension de la pathogenèse du diabète de type 2, notamment en identifiant un processus inflammatoire sous-jacent à l'échec de la production d'insuline dans cette maladie. Il a validé cette hypothèse grâce au premier essai clinique démontrant que la modulation du système immunitaire peut améliorer le métabolisme chez les patients diabétiques de type 2. Ses travaux ont ainsi participé à l’émergence du concept d’immunométabolisme, selon lequel le système immunitaire inné joue un rôle central dans la régulation du métabolisme.